Как осуществляется выполнение функции Sum()? Место прототипа функции (Sum() ) вставляется реализация этой функции?
Оптимизатор может так сделать, если посчитает нужным (если функция малесюнькая. то затраты на переходы возвраты больше, чем вставить ее всю).
Или осуществляется переход на эту функцию, где она реализована(то есть в файле 2)?
и так тоже, если оптимизатор посчитал нужным, обычно, именно так.
когда вызывается функция Sum(), то указатель перемещается на адрес в памяти где находится функция Sum(), выполняет эту функцию и возвращается обратно в main(). Так ли это работает?
ну, в общем, да.
Или подскажите пожалуйста где и что нужно почитать что бы понять это.
В настройках компилятора включаем опцию "выдать листинг ассемблера и смотрим его. Поэтому ассемблер знать обязательно. Это понимание работы и отладка. Изучение ассемблера и архитектуры позволяет понять все эти вызовы-возвраты, что приоисходит с регистрами, стэком, прерываниями и т.д и т.п.
Полагаю, поиском здесь на форуме что-то типа "книжки по изучению микроконтроллеров" найти можно, они предлагались много раз.
З. Ы. Рекомендуемую литературу можно было бы давно сделать какой-нить закрепленной шапкой в ветках.... плохо, что этого нет на форуме